Rīgas zoodārza misija ir

• sniegt ieskatu daudzveidīgajā dzīvnieku pasaulē,
• praktiski līdzdarboties Latvijas un pasaules dzīvnieku sugu izpētē un saglabāšanā,
• aicināt saudzēt dzīvniekus un to dabisko dzīves vidi,
• kā arī rosināt izprast dabu mums līdzās un cilvēku vietu tajā.

Mūsdienu zoodārzu darbības pamatuzdevumus nosaka Pasaules zoodārzu un akvāriju stratēģija dabas saglabāšanā. Kopš 1992.gada Rīgas zoodārzs ir Eiropas Zoodārzu un akvāriju asociācijā - EAZA (European Association of Zoos and Aquaria). Dalība šajā organizācijā uzliek pienākumu uzturēt augstus standartus gan dzīvnieku labturībā, gan citās zoodārza darbības jomās. saskaņā ar EAZA formulētajiem zoodārzu stratēģiskajiem mērķiem, Rīgas zoodārzs uzņēmies piedalīties bioloģiskās daudzveidības saglabāšanā, ieguldīt resursus dabas aizsardzības projektos un veikt darbu vides izglītībā.